Здание МОУ «СОШ№ 5 г. Пугачева» введено в эксплуатацию в 1919 году как начальная школа.
На основании Постановления администрации Пугачевского муниципального района Саратовской области от 27 октября 2011 года № 1260 «О создании муниципальных бюджетных учреждений Пугачевского муниципального района Саратовской области» муниципальное образовательное учреждение «Средняя общеобразовательная школа №5 г. Пугачева Саратовской области» переименована в Муниципальное общеобразовательное учреждение «Средняя общеобразовательная школа №5 г. Пугачева Саратовской области». Это одно из современных образовательных учреждений города, в котором на сегодняшний день обучаются 629 школьников и работают 46 сотрудников.